瑪努公園位於馬德雷德迪奧斯大區和庫斯科大區境內，安第斯山脈東側斜坡上，是由懸崖峭壁延宕而來。公園佔地面積爲一百五十萬公頃，海拔高度爲一百五十米到四千兩百米之間不等。瑪努國家公園中受保護的生物種屬堪稱世界之最。該公園幾乎囊括了祕魯東部地區的所有生態環境因素：低層的熱帶叢林、山區森林和普納草地，每一種生態環境中都生長着各自的動物羣及植物羣，瑪努公園也因此它成爲亞馬孫盆地中最富有特色、也最具有代表性的公園。
植物學家認爲，該公園所含的植物種類勝於世界上其他任何一箇受保護的地區。在不同高度的地理位置上，生長着不同的植物羣。然而比較常見的植物類型是低層的熱帶雨林、山區熱帶雨林和普納草原。公園中至少有四個不同的民族部落長期居住，其中以阿拉瓦克民族中的馬奇根家族部落最大，也是最著名的一箇。移植栽培是該地居民主要的農業耕作方式。這些種族已被視爲公園的一箇天然組成部分，他們在公園中可以隨心所欲的活動，並且其生活方式對公園不會造成任何傷害。