迄今已有600多年的歷史。明朝初年曾是歸德侯府和漢王府。清朝爲江寧織造署、江南總督署、兩江總督署。清朝康熙、乾隆皇帝下江南時均以此爲“行宮”。1853年3月太平軍佔領南京，定都天京，洪秀全在此興建了規模宏大的太平天國天朝宮殿（天王府）。清軍攻破南京後，焚燬宮殿建築，於同治九年（1870）重建了兩江總督署。林則徐、曾國藩、李鴻章、劉坤一、沈葆楨、左宗棠、張之洞、端方等均任過兩江總督。
1911年10月辛亥革命爆發後，1912年1月1日，孫中山在此處宣誓就任中華民國臨時大總統，並組建了中國歷史上第一個共和制的國家政權──中華民國臨時政府。1912年4月，臨時政府結束，在這裏成立了以黃興爲留守的南京留守府；1913年“二次革命”中，又成爲討袁軍總司令部，黃興、何海鳴先後任司令。
1913年至1927年，這裏先後成爲江蘇都督府、江蘇督軍署、江蘇將軍府、江蘇督辦公署、副-、宣撫使署、五省聯軍總司令部、直魯聯軍聯合辦事處等機構。軍政主官有程德全、張勳、李純、齊燮元、盧永祥、馮國璋、孫傳芳、楊宇霆、張宗昌等人。
1927年4月南京國民政府成立後不久，即於9月移駐這裏辦公。1928年10月，國民政府實行"五院制"，闢國民政府東院（東花園）爲行政院辦公處，國府西院（西花園）爲國民政府參謀部和主計處。至1937年11月，譚延闓、蔣介石、林森先後任國民政府主席；譚延闓、宋子文、蔣介石、陳銘樞（代理）、孫科、汪精衛先後任行政院長；李濟深、何應欽、朱培德、蔣介石、程潛先後任總參謀長；陳其採爲主計長。
1937年12月南京淪陷後，國民政府先後成爲日軍第16師團部和僞維新政府行政院，以及汪僞政府的-、-和-；國府東院成爲僞交通部、鐵道部等機構；國府西院成爲僞軍事參議院。
1946年5月，國民政府"還都"南京後，這裏仍爲國民政府所在地。東花園成爲國民政府社會部、地政部、水利部和僑務委員會；西花園則成爲國民政府主計處、軍令部，-軍務局、首都衛戍總司令部。
1948年5月20日，蔣介石、李宗仁在"行憲國大"分別當選總統和副總統後，國民政府改稱-。
1949年4月23日南京解放，24日，中國人民解放軍佔領-。從此，揭開了中國歷史新的一頁。
南京解放後的近50年中，-一直作爲機關的辦公場所。自20世紀80年代以來，機關單位陸續搬遷，並於1998年在-舊址之上，開始籌建南京中國近代史遺址博物館。經過精心的規劃和五年的建設，至2003年已初具規模。目前，博物館總佔地面積爲9萬平方米，共分三個參觀區域。中區（中軸線）主要是國民政府、-及所屬機構；西區是孫中山的臨時大總統辦公室、祕書處和西花園，以及參謀部等；東區主要是行政院舊址、馬廄和東花園。一系列展館和史料陳列，則分佈在這三個區域中。
今天，正以諸多保存完好的近代中西建築遺存，國內獨一無二且厚重的歷史文化氛圍，珍貴的文物和史料，風景優美的自然環境，以及近30000平方米的休閒服務區，熱情地歡迎來自全國和海內外的佳賓。
2013年5月，國務院（國發[2013]13號）公佈南京中國近代史遺址博物館（總統府景區）爲全國重點文物保護單位。
地址：南京市玄武區長江路292號
類型：博物館歷史建築
等級：AAAA
遊玩時間：建議2-4小時
電話：025-84578888（票務事宜），025-84578700（諮詢與投訴）
官方網站：http://www.njztf.cn/
社交帳號：
開放時間：
3月-10月8:30-18:00，11月8:30-17:00；閉館前1小時停止售票，閉館前50分鐘停止入館。週一閉館，法定節假日除外；除夕閉館。
門票信息：
成人票40元/人，憑學生證可享受半價優惠。60週歲以上的老年人憑有效-購半票入園，70週歲以上的老年人憑有效-免費入園。
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